Il Collegio Sindacale dura in carica tre anni ed è composto da tre membri, di cui: uno designato dalla Regione, uno dal Ministero dell'Economia e delle Finanze e uno dal Ministero della Salute.È nominato dal Direttore Generale, composto da esperti in materia giuridica e contabile, cui compete il controllo sulla regolarità della gestione amministrativa, finanziaria, contabile e patrimoniale dell'Azienda. In particolare allo stesso sono attribuite le seguenti funzioni: a)verifica dell'amministrazione dell’Azienda sotto il profilo economico;b)vigilanza sull'osservanza della legge;c)accertamento della regolare tenuta della contabilità e della conformità del bilancio alle risultanzedei libri e delle scritture contabili, con espressione di parere sul bilancio preventivo e sul bilancio d'esercizio; d)effettuazione di periodiche verifiche di cassa;e)relazione con cadenza almeno trimestrale alla Regione, anche a richiesta di quest'ultima etrasmissione periodica; f)attività di ispezione e controllo, qualora necessaria, da espletarsi anche individualmente;g)tutte le altre attribuzioni previste dalla normativa vigente.